# #BLOSUM90 amino acid substitution matrix # #February 20, 1996 14:55 # A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W X Y Z * A 5 -2 -1 -3 -1 -3 0 -2 -2 -1 -2 -2 -2 -1 -1 -2 1 0 -1 -4 -1 -3 -1 -6 B -2 4 -4 4 0 -4 -2 -1 -5 -1 -5 -4 4 -3 -1 -2 0 -1 -4 -6 -2 -4 0 -6 C -1 -4 9 -5 -6 -3 -4 -5 -2 -4 -2 -2 -4 -4 -4 -5 -2 -2 -2 -4 -3 -4 -5 -6 D -3 4 -5 7 1 -5 -2 -2 -5 -1 -5 -4 1 -3 -1 -3 -1 -2 -5 -6 -2 -4 0 -6 E -1 0 -6 1 6 -5 -3 -1 -4 0 -4 -3 -1 -2 2 -1 -1 -1 -3 -5 -2 -4 4 -6 F -3 -4 -3 -5 -5 7 -5 -2 -1 -4 0 -1 -4 -4 -4 -4 -3 -3 -2 0 -2 3 -4 -6 G 0 -2 -4 -2 -3 -5 6 -3 -5 -2 -5 -4 -1 -3 -3 -3 -1 -3 -5 -4 -2 -5 -3 -6 H -2 -1 -5 -2 -1 -2 -3 8 -4 -1 -4 -3 0 -3 1 0 -2 -2 -4 -3 -2 1 0 -6 I -2 -5 -2 -5 -4 -1 -5 -4 5 -4 1 1 -4 -4 -4 -4 -3 -1 3 -4 -2 -2 -4 -6 K -1 -1 -4 -1 0 -4 -2 -1 -4 6 -3 -2 0 -2 1 2 -1 -1 -3 -5 -1 -3 1 -6 L -2 -5 -2 -5 -4 0 -5 -4 1 -3 5 2 -4 -4 -3 -3 -3 -2 0 -3 -2 -2 -4 -6 M -2 -4 -2 -4 -3 -1 -4 -3 1 -2 2 7 -3 -3 0 -2 -2 -1 0 -2 -1 -2 -2 -6 N -2 4 -4 1 -1 -4 -1 0 -4 0 -4 -3 7 -3 0 -1 0 0 -4 -5 -2 -3 -1 -6 P -1 -3 -4 -3 -2 -4 -3 -3 -4 -2 -4 -3 -3 8 -2 -3 -2 -2 -3 -5 -2 -4 -2 -6 Q -1 -1 -4 -1 2 -4 -3 1 -4 1 -3 0 0 -2 7 1 -1 -1 -3 -3 -1 -3 4 -6 R -2 -2 -5 -3 -1 -4 -3 0 -4 2 -3 -2 -1 -3 1 6 -1 -2 -3 -4 -2 -3 0 -6 S 1 0 -2 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -3 -2 0 -2 -1 -1 5 1 -2 -4 -1 -3 -1 -6 T 0 -1 -2 -2 -1 -3 -3 -2 -1 -1 -2 -1 0 -2 -1 -2 1 6 -1 -4 -1 -2 -1 -6 V -1 -4 -2 -5 -3 -2 -5 -4 3 -3 0 0 -4 -3 -3 -3 -2 -1 5 -3 -2 -3 -3 -6 W -4 -6 -4 -6 -5 0 -4 -3 -4 -5 -3 -2 -5 -5 -3 -4 -4 -4 -3 11 -3 2 -4 -6 X -1 -2 -3 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -2 -1 -2 -2 -1 -2 -1 -1 -2 -3 -2 -2 -1 -6 Y -3 -4 -4 -4 -4 3 -5 1 -2 -3 -2 -2 -3 -4 -3 -3 -3 -2 -3 2 -2 8 -3 -6 Z -1 0 -5 0 4 -4 -3 0 -4 1 -4 -2 -1 -2 4 0 -1 -1 -3 -4 -1 -3 4 -6 * -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 1