# #BLOSUM80 amino acid substitution matrix #February 20, 1996 14:55 # A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W X Y Z * A 7 -3 -1 -3 -2 -4 0 -3 -3 -1 -3 -2 -3 -1 -2 -3 2 0 -1 -5 -1 -4 -2 -8 B -3 6 -6 6 1 -6 -2 -1 -6 -1 -7 -5 5 -4 -1 -2 0 -1 -6 -8 -3 -5 0 -8 C -1 -6 13 -7 -7 -4 -6 -7 -2 -6 -3 -3 -5 -6 -5 -6 -2 -2 -2 -5 -4 -5 -7 -8 D -3 6 -7 10 2 -6 -3 -2 -7 -2 -7 -6 2 -3 -1 -3 -1 -2 -6 -8 -3 -6 1 -8 E -2 1 -7 2 8 -6 -4 0 -6 1 -6 -4 -1 -2 3 -1 -1 -2 -4 -6 -2 -5 6 -8 F -4 -6 -4 -6 -6 10 -6 -2 -1 -5 0 0 -6 -6 -5 -5 -4 -4 -2 0 -3 4 -6 -8 G 0 -2 -6 -3 -4 -6 9 -4 -7 -3 -7 -5 -1 -5 -4 -4 -1 -3 -6 -6 -3 -6 -4 -8 H -3 -1 -7 -2 0 -2 -4 12 -6 -1 -5 -4 1 -4 1 0 -2 -3 -5 -4 -2 3 0 -8 I -3 -6 -2 -7 -6 -1 -7 -6 7 -5 2 2 -6 -5 -5 -5 -4 -2 4 -5 -2 -3 -6 -8 K -1 -1 -6 -2 1 -5 -3 -1 -5 8 -4 -3 0 -2 2 3 -1 -1 -4 -6 -2 -4 1 -8 L -3 -7 -3 -7 -6 0 -7 -5 2 -4 6 3 -6 -5 -4 -4 -4 -3 1 -4 -2 -2 -5 -8 M -2 -5 -3 -6 -4 0 -5 -4 2 -3 3 9 -4 -4 -1 -3 -3 -1 1 -3 -2 -3 -3 -8 N -3 5 -5 2 -1 -6 -1 1 -6 0 -6 -4 9 -4 0 -1 1 0 -5 -7 -2 -4 -1 -8 P -1 -4 -6 -3 -2 -6 -5 -4 -5 -2 -5 -4 -4 12 -3 -3 -2 -3 -4 -7 -3 -6 -2 -8 Q -2 -1 -5 -1 3 -5 -4 1 -5 2 -4 -1 0 -3 9 1 -1 -1 -4 -4 -2 -3 5 -8 R -3 -2 -6 -3 -1 -5 -4 0 -5 3 -4 -3 -1 -3 1 9 -2 -2 -4 -5 -2 -4 0 -8 S 2 0 -2 -1 -1 -4 -1 -2 -4 -1 -4 -3 1 -2 -1 -2 7 2 -3 -6 -1 -3 -1 -8 T 0 -1 -2 -2 -2 -4 -3 -3 -2 -1 -3 -1 0 -3 -1 -2 2 8 0 -5 -1 -3 -2 -8 V -1 -6 -2 -6 -4 -2 -6 -5 4 -4 1 1 -5 -4 -4 -4 -3 0 7 -5 -2 -3 -4 -8 W -5 -8 -5 -8 -6 0 -6 -4 -5 -6 -4 -3 -7 -7 -4 -5 -6 -5 -5 16 -5 3 -5 -8 X -1 -3 -4 -3 -2 -3 -3 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -2 -2 -1 -1 -2 -5 -2 -3 -1 -8 Y -4 -5 -5 -6 -5 4 -6 3 -3 -4 -2 -3 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -3 3 -3 11 -4 -8 Z -2 0 -7 1 6 -6 -4 0 -6 1 -5 -3 -1 -2 5 0 -1 -2 -4 -5 -1 -4 6 -8 * -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 1