# #BLOSUM55 amino acid substitution matrix # #February 20, 1996 14:54 # A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W X Y Z * A 5 -2 0 -2 -1 -3 0 -2 -2 -1 -2 -1 -2 -1 -1 -2 2 0 0 -4 -1 -2 -1 -5 B -2 5 -4 5 1 -5 -1 0 -4 0 -4 -3 4 -2 0 -1 0 -1 -4 -5 -1 -3 2 -5 C 0 -4 13 -4 -4 -3 -3 -4 -2 -4 -2 -2 -3 -3 -4 -4 -1 -1 -1 -4 -2 -3 -4 -5 D -2 5 -4 8 2 -5 -2 -1 -4 -1 -5 -4 2 -2 0 -2 0 -1 -4 -5 -2 -3 1 -5 E -1 1 -4 2 7 -4 -3 -1 -4 1 -4 -3 0 -1 2 0 0 -1 -3 -3 -1 -2 5 -5 F -3 -5 -3 -5 -4 9 -4 -1 0 -4 1 0 -4 -5 -4 -3 -3 -3 -1 2 -2 4 -4 -5 G 0 -1 -3 -2 -3 -4 8 -2 -5 -2 -5 -3 0 -3 -2 -3 0 -2 -4 -3 -2 -4 -3 -5 H -2 0 -4 -1 -1 -1 -2 11 -4 0 -3 -2 1 -3 1 0 -1 -2 -4 -3 -1 2 0 -5 I -2 -4 -2 -4 -4 0 -5 -4 6 -4 2 2 -4 -3 -4 -4 -3 -1 4 -3 -1 -1 -4 -5 K -1 0 -4 -1 1 -4 -2 0 -4 6 -3 -2 0 -1 2 3 0 -1 -3 -4 -1 -2 1 -5 L -2 -4 -2 -5 -4 1 -5 -3 2 -3 6 3 -4 -4 -3 -3 -3 -2 1 -3 -1 -1 -3 -5 M -1 -3 -2 -4 -3 0 -3 -2 2 -2 3 8 -3 -3 0 -2 -2 -1 1 -2 -1 -1 -2 -5 N -2 4 -3 2 0 -4 0 1 -4 0 -4 -3 8 -2 0 -1 1 0 -4 -5 -1 -2 0 -5 P -1 -2 -3 -2 -1 -5 -3 -3 -3 -1 -4 -3 -2 10 -1 -3 -1 -1 -3 -5 -2 -4 -1 -5 Q -1 0 -4 0 2 -4 -2 1 -4 2 -3 0 0 -1 7 1 0 -1 -3 -2 -1 -1 4 -5 R -2 -1 -4 -2 0 -3 -3 0 -4 3 -3 -2 -1 -3 1 8 -1 -1 -3 -3 -1 -2 0 -5 S 2 0 -1 0 0 -3 0 -1 -3 0 -3 -2 1 -1 0 -1 5 2 -2 -4 -1 -2 0 -5 T 0 -1 -1 -1 -1 -3 -2 -2 -1 -1 -2 -1 0 -1 -1 -1 2 6 0 -3 -1 -2 -1 -5 V 0 -4 -1 -4 -3 -1 -4 -4 4 -3 1 1 -4 -3 -3 -3 -2 0 5 -4 -1 -2 -3 -5 W -4 -5 -4 -5 -3 2 -3 -3 -3 -4 -3 -2 -5 -5 -2 -3 -4 -3 -4 15 -3 3 -3 -5 X -1 -1 -2 -2 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -3 -1 -1 -1 -5 Y -2 -3 -3 -3 -2 4 -4 2 -1 -2 -1 -1 -2 -4 -1 -2 -2 -2 -2 3 -1 9 -2 -5 Z -1 2 -4 1 5 -4 -3 0 -4 1 -3 -2 0 -1 4 0 0 -1 -3 -3 -1 -2 5 -5 * -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 1